課程資訊
課程名稱
次世代定序在分子生物學上的應用
Applications of NGS sequencing in Molecular Biology 
開課學期
108-1 
授課對象
生命科學院  分子與細胞生物學研究所  
授課教師
朱雪萍 
課號
MCB5037 
課程識別碼
B43 U1530 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
 
上課地點
 
備註
需修過分子生物學。時間地點另定,開學向授課老師查詢。
總人數上限:20人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1081MCB5037_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

次世代定序的方法已廣泛應用在探討分子生物學上的分子機制,但數據龐大,必須使用的大數據分析方法,一般生物背景的研究生大都缺乏大數據分析的能力。此外,在探討分子生物學上的分子機制中,目前科學界,正加速開發各種新式的次世代定序備置方法已解決各式各樣的生物問題,例如:疾病遺傳學,表觀遺傳學,核糖核酸與蛋白質的交互作用,核糖核酸的結構與剪切,DNA變異等等的課題都可利用次世代定序的方式來研究。此課程目標以培養具備大數據資訊分析,使分子生物學背景的學生,能廣泛使用此方法,來解決分子生物性問題。 

課程目標
1 培育具有大數據分析能力兼分子生物專業的人才
2 增進跨領域學習與交流
3 專業領域的增進與提升創新能力
 
課程要求
待補 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 備註: 上課地點 週三上午 10:20-12:10 9/11 生科館 4A 教室 9/18 以後 生科館 3C 教室 
指定閱讀
待補 
參考書目
待補 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
上課參與 
20% 
 
2. 
期中報告 
30% 
 
3. 
期末報告 
50% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第2週
9/11  次世代定序在分子生物學上的應用簡介與原理 
第3週
9/18  RNA-seq 原理與應用工具 
第4週
9/25  ChIP-seq原理與應用工具
網路資源應用:IGV, UCSC genome browser, David genome 
第5週
10/2  Unix 系統與國網使用--國網中心葉昌偉/黃介瑋 
第6週
10/9  邀請演講1--中研院植微所陳柏仰實驗室研究團隊 
第7週
10/23  邀請演講2--中研院資訊科學研究所蔡懷寬 
第8週
10/30  文獻討論1---學生報告NGS應用之技術
小組:陳婷芳、施佳妤、何美瑩
小組:駱辰嘉、陳雲飛、陳昱甄 
第9週
11/6  邀請演講3--儲瑞華博士
CLC Genomics Workbench: A powerful solution that works for everyone  
第10週
11/13  文獻討論2---學生報告NGS應用之技術
小組:楊博丞、蔡如宣、范嘉恆
小組:洪鎰保、邱培真 
第11週
11/20  邀請演講4--中研院基因體中心莊樹諄 
第12週
11/27  文獻討論3---學生報告NGS應用之技術
小組:陳昀,黃家恩,顏建平
小組:沈宏智、顧家瑜、彭若晴 
第13週
12/4  R 工具的應用與實作 
第14週
12/11  個案討論報告與實作

報告學生:
(楊博丞、陳昱甄)、陳雲飛、陳昀 
第15週
12/18  個案討論報告與實作

報告學生:
(顏建平、蔡如宣)、施佳妤 
第16週
12/25  個案討論報告與實作

報告學生:
(洪鎰保、邱培真)、(何美螢、黃佳恩) 
第17週
1/8  個案討論報告與實作

報告學生:
(顧家瑜、駱辰嘉、彭若晴)、(沈宏智、范嘉恆)